近年工安及環保事件頻傳，且勞工意識、 環保意識高漲，因此工業安全及環境污染問題，倍受重視。為因應社會趨勢，本校結合環境及安全工程與技術，於民國九十一年成立環境與安全工程學系以培養同時具環境保護技術與工業安全技術之專業人才。除原環工與安全兩大領域外，本系進一步於民國九十三年納入衛生研究領域，並同時更名為環境與安全衛生工程系。

為配合國內企業90%以上均將環境保護與安全衛生併入同單位(安環處或安環室)實施，業界極需能同時具有環保與安衛本職學能之人才，以培養業界所需之中高階人力，本系為雲林以南地區整合環境工程與安全衛生教育訓練之唯一私立大學。

本系之課程規劃為環保與安衛課程並重，兩者課程發展均衡，環工與安衛課程必修學分比例為21：19。必修課程為配合技職體系實務特性與證照考試之規劃，學生修畢本系課程可同時報考環保與安衛兩大領域證照，出路廣泛。

本系配合教育部南部地區教育資源規劃及整合校內資源而規畫以環境污染防制技術、工業安全與衛生等三大方向為發展主軸，整合該領域之研究，期能培育學生具備基礎環工領域技能，如水、空氣、廢棄物、毒性化學物質處理及管理能力，工業安全及衛生工程與管理專業知識，如工廠程序安全、安全衛生法規、風險危害評估、作業環境測定等，並透過實場實務之操作訓練、專業證照的取得以培育環安界之中高階人才。

本校位近南科及各工業區，距仁德交流道僅兩公里路程，交通便利；而本系配合南部石化化工廠及南科園區，加強環境污染防治及工業安全技能之養成。於九十二年開始招收環安系日四技兩班，推甄於工程類及機械類招生。聯合登記分發於工程類、機械類、汽車類及化工類招生；而申請入學則招收高中完全中學、綜合高中及高職附設普通科畢業生且參加大學入學考試符合條件者。（詳情請參閱各招簡章）

本系畢業前可考之有價證照:甲種職業安全衛生業務主管、固體廢棄物處理技術員(乙級) 、毒性化學物質專業技術管理人員(丙級)、職業安全衛生管理員(乙級)、化學性因子作業環境監測技術士(乙級)、物理性因子作業環境監測技術士(乙級)、下水道設施操作維護技術士(乙級)(水質檢驗、處理系統、管渠系統、及機電設備)、消防設備士、防火防爆管理員。畢業後可考之有價證照:職業安全管理師(甲級)、職業衛生管理師(甲級)、消防設備師、空氣污染防制專責人員(甲級、乙級) 、廢水處理專責人員(甲級、乙級) 、廢棄物清除專業技術人員( 甲級) 、廢棄物處理專業技術人員(甲級) 、毒性化學物質專業技術管理人員(甲級、乙級) 、化學性因子作業環境監測技術士(甲級)、物理性因子作業環境監測技術士(甲級)、職業衛生技師.